Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF35P13682 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms