Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ITGA4P13612 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms