Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN1P12814 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms