Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
VPREB1P12018 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms