Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGAMP11215 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms