Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L2BP0DMW5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L2BP0DMW5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms