Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC166P0CW27 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms