Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms