Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MMP3P08254 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MMP3P08254 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MMP3P08254 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MMP3P08254 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MMP3P08254 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP3P08254 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP3P08254 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP3P08254 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP3P08254 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP3P08254 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP3P08254 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP3P08254 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MMP3P08254 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms