Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A1BGP04217 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A1BGP04217 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A1BGP04217 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A1BGP04217 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A1BGP04217 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A1BGP04217 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A1BGP04217 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A1BGP04217 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A1BGP04217 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A1BGP04217 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A1BGP04217 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A1BGP04217 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A1BGP04217 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A1BGP04217 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A1BGP04217 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A1BGP04217 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A1BGP04217 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A1BGP04217 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A1BGP04217 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
A1BGP04217 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
A1BGP04217 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A1BGP04217 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A1BGP04217 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A1BGP04217 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A1BGP04217 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
A1BGP04217 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A1BGP04217 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A1BGP04217 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms