Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC24BO95487 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms