Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RHOBTB3O94955 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RHOBTB3O94955 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms