Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNSO60931 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNSO60931 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNSO60931 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTNSO60931 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms