Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLXNC1O60486 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PLXNC1O60486 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNC1O60486 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms