Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIN3BO60391 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIN3BO60391 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms