Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
KIAA0556O60303 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KIAA0556O60303 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms