Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX6O43752 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX6O43752 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
STX6O43752 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
STX6O43752 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX6O43752 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX6O43752 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms