Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF3O43395 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF3O43395 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms