Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPAA1O43292 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms