Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIPA1L1O43166 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms