Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PHOX2AO14813 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PHOX2AO14813 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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