Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PIK3C2AO00443 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3C2AO00443 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms