Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HIP1O00291 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIP1O00291 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIP1O00291 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIP1O00291 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIP1O00291 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms