Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C1D1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C1D1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C1D1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C1D1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C1D1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C1D1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C1D1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C1D1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C1D1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C1D1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C1D1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H7C1D1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H7C1D1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H7C1D1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H7C1D1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C1D1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C1D1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C1D1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C1D1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C1D1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C1D1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C1D1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C1D1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C1D1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C1D1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C1D1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C1D1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H7C1D1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1D1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1D1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1D1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1D1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1D1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1D1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1D1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1D1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1D1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H7C1D1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms