Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-2B6SEH9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-2B6SEH9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms