Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF879B4DU55 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms