Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEURL1BA8MQ27 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEURL1BA8MQ27 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms