Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLTPD2A6NH11 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLTPD2A6NH11 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms