Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L4A6NCW7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms