Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM89A2RUT3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms