Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms