Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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FOXQ1Q9C009 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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FOXQ1Q9C009 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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FOXQ1Q9C009 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXQ1Q9C009 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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