Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms