Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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COL24A1Q17RW2 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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COL24A1Q17RW2 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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COL24A1Q17RW2 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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COL24A1Q17RW2 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
COL24A1Q17RW2 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
COL24A1Q17RW2 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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