Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms