Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms