Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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PTP4A2Q12974 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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PTP4A2Q12974 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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PTP4A2Q12974 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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PTP4A2Q12974 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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PTP4A2Q12974 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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PTP4A2Q12974 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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PTP4A2Q12974 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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PTP4A2Q12974 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTP4A2Q12974 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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