Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
BRD3Q15059 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
BRD3Q15059 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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