Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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MKRN3Q13064 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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MKRN3Q13064 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
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MKRN3Q13064 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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MKRN3Q13064 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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MKRN3Q13064 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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MKRN3Q13064 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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MKRN3Q13064 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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MKRN3Q13064 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
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MKRN3Q13064 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
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MKRN3Q13064 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
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MKRN3Q13064 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
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