Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 MTMR11-202ENST00000439741 2827 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OPCML-201ENST00000331898 6833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBBP1-201ENST00000248151 1335 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHA6-201ENST00000389672 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM38B-202ENST00000374692 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BRDT-205ENST00000399546 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF268-206ENST00000536899 3236 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SOX5-210ENST00000537393 2769 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCB8-222ENST00000542328 4371 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AGPAT4-203ENST00000366911 7705 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ACBD5-205ENST00000396271 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DPP6-201ENST00000332007 3768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF488-201ENST00000585316 3496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TIMP2-203ENST00000585421 3345 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLFN11-202ENST00000394566 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM239-201ENST00000361033 3892 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 C6orf222-201ENST00000437635 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A6-202ENST00000354181 4568 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CX3CR1-205ENST00000541347 3255 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 GRID1-201ENST00000327946 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFSF15-202ENST00000374045 6687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TRBV5-6-201ENST00000390375 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP207-201ENST00000390874 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL356277.1-201ENST00000401875 267 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPS21P6-201ENST00000415184 261 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114489.1-201ENST00000421619 395 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL627313.1-201ENST00000428860 238 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PGAM4-201ENST00000458128 765 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL394P-201ENST00000480997 291 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL127P-201ENST00000494856 300 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ACA64.6-201ENST00000516310 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2D-18-201ENST00000519785 375 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ENSAP2-201ENST00000554405 352 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV1OR16-4-201ENST00000566350 205 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC109495.1-201ENST00000568026 551 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015853.2-201ENST00000571282 493 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL509P-201ENST00000579670 297 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TDGF1P7-201ENST00000593394 559 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138966.1-201ENST00000603212 313 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6511A2-201ENST00000611011 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms