Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 KCNH7-202ENST00000332142 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 MAPK10-248ENST00000640490 2715 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 CTNNA2-201ENST00000343114 2927 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 HHAT-204ENST00000413764 3575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 ZNRD1ASP-211ENST00000376797 3270 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 PPFIBP2-216ENST00000530181 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AF254983.1-201ENST00000612267 3336 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 EFCAB1-201ENST00000262103 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 RUNX1T1-203ENST00000396218 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 TPP2-202ENST00000376065 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 GMDS-AS1-202ENST00000505870 8217 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 CPA4-201ENST00000222482 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 AL591379.1-201ENST00000315293 3739 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 FSD1L-202ENST00000374710 7664 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 CTPS2-202ENST00000380241 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 PRDM11-206ENST00000622142 10730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
LHX8Q68G74 BHLHB9-205ENST00000457056 4082 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms