Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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SGCBQ16585 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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SGCBQ16585 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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SGCBQ16585 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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SGCBQ16585 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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SGCBQ16585 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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SGCBQ16585 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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SGCBQ16585 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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