Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
GAPVD1Q14C86 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
GAPVD1Q14C86 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GAPVD1Q14C86 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
GAPVD1Q14C86 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
GAPVD1Q14C86 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GAPVD1Q14C86 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
GAPVD1Q14C86 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
GAPVD1Q14C86 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
GAPVD1Q14C86 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
GAPVD1Q14C86 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
GAPVD1Q14C86 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
GAPVD1Q14C86 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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