Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RN7SL751P-201ENST00000473281 284 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC116535.1-201ENST00000499765 2335 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 GCNT3-209ENST00000560585 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms