Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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