Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDGFRLQ15198 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDGFRLQ15198 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.1 ms