Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms