Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPRGP23470 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms