Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FXNQ16595 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
FXNQ16595 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.9 ms