Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CPEB3-202ENST00000412050 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERC1Q15751 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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